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中国科学家运用人工智能算法发现大量全新RNA病毒
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简介中新社广州10月10日电 (许青青 朱嘉豪)据中山大学9日晚发布的消息,中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志发表论文,报告了全球范围的180个超群、16万余种RNA病 ...
中新社广州10月10日电 (许青青 朱嘉豪)据中山大学9日晚发布的中国消息,中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志发表论文,科学报告了全球范围的家运180个超群、16万余种RNA病毒的用人发现,大幅扩展全球RNA病毒的工智多样性。
据介绍,现大新传统的量全病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,病毒面对RNA病毒这种高度分化、中国种类繁多且容易变异的科学病毒识别效率低。该研究团队开发的家运LucaProt人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列深度学习,并在数据集中自主判断病毒序列。用人
利用这套算法,工智研究团队在来自全球生物环境样本的现大新10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。量全其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。
通过进一步分析,团队报告了迄今最长的RNA病毒基因组,长度达到47250个核苷酸;发现了超出以往认知的基因组结构,展现出RNA病毒基因组进化的灵活性;识别到多种病毒功能蛋白,特别是与细菌相关的功能蛋白,进一步表明还有更多类型的RNA噬菌体亟待探索;发现在南极底泥、深海热泉、活性污泥和盐碱滩等极端环境中,RNA病毒的数量和多样性仍然较高。
“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这种能力在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要。特别是在疫情暴发时,人工智能的速度和精度可以帮助科学家更快地锁定潜在病原体。”施莽介绍说,研究显示病毒的多样性远超人类想象,人类目前所看到的仍是冰山一角,未来病毒分类体系可能会有大规模的调整。
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